Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCNT1Q02742 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCNT1Q02742 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms