Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SATB1Q01826 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms