Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
OTUD4Q01804 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD4Q01804 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms