Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms