Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms