Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms