Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms