Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms