Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP2C1P98194 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2C1P98194 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms