Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
IRX6P78412 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRX6P78412 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRX6P78412 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRX6P78412 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRX6P78412 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRX6P78412 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRX6P78412 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRX6P78412 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRX6P78412 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRX6P78412 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRX6P78412 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRX6P78412 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRX6P78412 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRX6P78412 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRX6P78412 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRX6P78412 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRX6P78412 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRX6P78412 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRX6P78412 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IRX6P78412 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IRX6P78412 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
IRX6P78412 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IRX6P78412 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IRX6P78412 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IRX6P78412 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IRX6P78412 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRX6P78412 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRX6P78412 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRX6P78412 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRX6P78412 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRX6P78412 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRX6P78412 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRX6P78412 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRX6P78412 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRX6P78412 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRX6P78412 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRX6P78412 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRX6P78412 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRX6P78412 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRX6P78412 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
IRX6P78412 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
IRX6P78412 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
IRX6P78412 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRX6P78412 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRX6P78412 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRX6P78412 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRX6P78412 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRX6P78412 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRX6P78412 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IRX6P78412 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
IRX6P78412 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRX6P78412 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRX6P78412 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRX6P78412 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRX6P78412 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRX6P78412 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRX6P78412 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRX6P78412 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRX6P78412 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRX6P78412 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IRX6P78412 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRX6P78412 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRX6P78412 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRX6P78412 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRX6P78412 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
IRX6P78412 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRX6P78412 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRX6P78412 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRX6P78412 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IRX6P78412 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRX6P78412 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRX6P78412 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRX6P78412 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRX6P78412 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRX6P78412 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRX6P78412 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRX6P78412 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRX6P78412 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRX6P78412 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
IRX6P78412 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRX6P78412 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRX6P78412 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IRX6P78412 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IRX6P78412 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IRX6P78412 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IRX6P78412 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IRX6P78412 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IRX6P78412 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IRX6P78412 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IRX6P78412 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IRX6P78412 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IRX6P78412 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IRX6P78412 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IRX6P78412 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IRX6P78412 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IRX6P78412 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IRX6P78412 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX6P78412 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX6P78412 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms