Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPC5P78333 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPC5P78333 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPC5P78333 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC5P78333 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC5P78333 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC5P78333 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC5P78333 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC5P78333 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC5P78333 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC5P78333 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC5P78333 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC5P78333 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC5P78333 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC5P78333 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC5P78333 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC5P78333 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC5P78333 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC5P78333 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC5P78333 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC5P78333 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC5P78333 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC5P78333 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC5P78333 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC5P78333 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC5P78333 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC5P78333 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC5P78333 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC5P78333 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC5P78333 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC5P78333 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC5P78333 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC5P78333 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC5P78333 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC5P78333 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC5P78333 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC5P78333 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC5P78333 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC5P78333 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC5P78333 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC5P78333 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC5P78333 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC5P78333 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC5P78333 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC5P78333 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC5P78333 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC5P78333 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC5P78333 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC5P78333 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC5P78333 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC5P78333 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC5P78333 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC5P78333 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC5P78333 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC5P78333 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC5P78333 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC5P78333 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC5P78333 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC5P78333 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC5P78333 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC5P78333 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC5P78333 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC5P78333 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC5P78333 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC5P78333 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC5P78333 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC5P78333 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC5P78333 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC5P78333 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC5P78333 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC5P78333 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC5P78333 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC5P78333 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC5P78333 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC5P78333 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC5P78333 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC5P78333 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC5P78333 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC5P78333 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC5P78333 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC5P78333 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC5P78333 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC5P78333 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC5P78333 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC5P78333 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC5P78333 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC5P78333 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC5P78333 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC5P78333 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC5P78333 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC5P78333 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC5P78333 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC5P78333 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC5P78333 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC5P78333 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC5P78333 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC5P78333 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC5P78333 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC5P78333 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC5P78333 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms