Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL11P62913 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL11P62913 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL11P62913 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPL11P62913 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL11P62913 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL11P62913 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL11P62913 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL11P62913 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL11P62913 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL11P62913 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL11P62913 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL11P62913 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL11P62913 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL11P62913 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL11P62913 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL11P62913 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL11P62913 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL11P62913 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL11P62913 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL11P62913 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL11P62913 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL11P62913 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPL11P62913 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL11P62913 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL11P62913 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL11P62913 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL11P62913 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL11P62913 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL11P62913 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL11P62913 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL11P62913 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL11P62913 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL11P62913 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL11P62913 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL11P62913 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL11P62913 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL11P62913 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL11P62913 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL11P62913 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL11P62913 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL11P62913 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL11P62913 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL11P62913 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL11P62913 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL11P62913 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL11P62913 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL11P62913 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL11P62913 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL11P62913 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL11P62913 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL11P62913 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL11P62913 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL11P62913 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL11P62913 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL11P62913 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL11P62913 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL11P62913 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL11P62913 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL11P62913 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL11P62913 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL11P62913 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL11P62913 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL11P62913 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL11P62913 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL11P62913 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL11P62913 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL11P62913 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL11P62913 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL11P62913 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL11P62913 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms