Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPFP62306 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPFP62306 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPFP62306 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPFP62306 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPFP62306 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPFP62306 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPFP62306 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPFP62306 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPFP62306 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPFP62306 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPFP62306 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPFP62306 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPFP62306 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPFP62306 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPFP62306 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPFP62306 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPFP62306 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPFP62306 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPFP62306 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPFP62306 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPFP62306 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPFP62306 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPFP62306 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPFP62306 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPFP62306 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms