Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE2HP62256 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2HP62256 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms