Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK11-1P61568 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms