Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVFRD-1P60508 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVFRD-1P60508 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms