Protein–RNA interactions for Protein: P60174

TPI1, Triosephosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1P60174 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPI1P60174 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TPI1P60174 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPI1P60174 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPI1P60174 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPI1P60174 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TPI1P60174 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPI1P60174 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPI1P60174 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPI1P60174 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPI1P60174 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPI1P60174 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPI1P60174 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPI1P60174 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPI1P60174 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPI1P60174 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPI1P60174 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TPI1P60174 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPI1P60174 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPI1P60174 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPI1P60174 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPI1P60174 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPI1P60174 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPI1P60174 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPI1P60174 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPI1P60174 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPI1P60174 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPI1P60174 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPI1P60174 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPI1P60174 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPI1P60174 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPI1P60174 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPI1P60174 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPI1P60174 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPI1P60174 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPI1P60174 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPI1P60174 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPI1P60174 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPI1P60174 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPI1P60174 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPI1P60174 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPI1P60174 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPI1P60174 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPI1P60174 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPI1P60174 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPI1P60174 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPI1P60174 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPI1P60174 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TPI1P60174 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPI1P60174 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TPI1P60174 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPI1P60174 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TPI1P60174 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPI1P60174 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPI1P60174 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPI1P60174 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPI1P60174 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TPI1P60174 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TPI1P60174 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TPI1P60174 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPI1P60174 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPI1P60174 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPI1P60174 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPI1P60174 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPI1P60174 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPI1P60174 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPI1P60174 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPI1P60174 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPI1P60174 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPI1P60174 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPI1P60174 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPI1P60174 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPI1P60174 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPI1P60174 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPI1P60174 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPI1P60174 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPI1P60174 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPI1P60174 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPI1P60174 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPI1P60174 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPI1P60174 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPI1P60174 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPI1P60174 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPI1P60174 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPI1P60174 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPI1P60174 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPI1P60174 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPI1P60174 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPI1P60174 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPI1P60174 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPI1P60174 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPI1P60174 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPI1P60174 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPI1P60174 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPI1P60174 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPI1P60174 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPI1P60174 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPI1P60174 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPI1P60174 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPI1P60174 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms