Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP4BP1P59074 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP4BP1P59074 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms