Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRLP54845 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRLP54845 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRLP54845 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRLP54845 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRLP54845 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRLP54845 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRLP54845 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRLP54845 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRLP54845 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRLP54845 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NRLP54845 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NRLP54845 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRLP54845 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRLP54845 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRLP54845 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRLP54845 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRLP54845 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRLP54845 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRLP54845 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRLP54845 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRLP54845 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NRLP54845 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRLP54845 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRLP54845 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NRLP54845 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRLP54845 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRLP54845 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRLP54845 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRLP54845 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRLP54845 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRLP54845 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRLP54845 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRLP54845 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRLP54845 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRLP54845 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRLP54845 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRLP54845 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NRLP54845 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRLP54845 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NRLP54845 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRLP54845 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRLP54845 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRLP54845 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRLP54845 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRLP54845 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRLP54845 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRLP54845 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRLP54845 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRLP54845 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRLP54845 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRLP54845 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRLP54845 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRLP54845 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NRLP54845 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRLP54845 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRLP54845 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRLP54845 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRLP54845 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRLP54845 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRLP54845 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRLP54845 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRLP54845 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRLP54845 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRLP54845 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRLP54845 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRLP54845 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRLP54845 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRLP54845 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRLP54845 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRLP54845 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRLP54845 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRLP54845 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRLP54845 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRLP54845 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRLP54845 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRLP54845 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRLP54845 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRLP54845 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRLP54845 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRLP54845 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRLP54845 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRLP54845 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRLP54845 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRLP54845 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRLP54845 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRLP54845 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRLP54845 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRLP54845 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRLP54845 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRLP54845 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRLP54845 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRLP54845 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRLP54845 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRLP54845 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRLP54845 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRLP54845 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRLP54845 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRLP54845 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRLP54845 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 316 ms