Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms