Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms