Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CRISP3P54108 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms