Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PGGT1BP53609 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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