Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV1P50549 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV1P50549 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV1P50549 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV1P50549 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV1P50549 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV1P50549 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV1P50549 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV1P50549 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV1P50549 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV1P50549 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV1P50549 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV1P50549 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV1P50549 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV1P50549 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV1P50549 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ETV1P50549 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ETV1P50549 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETV1P50549 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETV1P50549 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETV1P50549 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETV1P50549 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETV1P50549 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETV1P50549 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ETV1P50549 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETV1P50549 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ETV1P50549 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETV1P50549 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ETV1P50549 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETV1P50549 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETV1P50549 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETV1P50549 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETV1P50549 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETV1P50549 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETV1P50549 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETV1P50549 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETV1P50549 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETV1P50549 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETV1P50549 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETV1P50549 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETV1P50549 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETV1P50549 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETV1P50549 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ETV1P50549 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETV1P50549 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETV1P50549 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETV1P50549 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETV1P50549 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETV1P50549 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETV1P50549 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETV1P50549 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETV1P50549 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETV1P50549 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETV1P50549 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETV1P50549 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETV1P50549 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETV1P50549 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETV1P50549 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ETV1P50549 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETV1P50549 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETV1P50549 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETV1P50549 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETV1P50549 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETV1P50549 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETV1P50549 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETV1P50549 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETV1P50549 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETV1P50549 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETV1P50549 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETV1P50549 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETV1P50549 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETV1P50549 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETV1P50549 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETV1P50549 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ETV1P50549 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV1P50549 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV1P50549 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV1P50549 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV1P50549 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV1P50549 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV1P50549 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV1P50549 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV1P50549 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV1P50549 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV1P50549 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV1P50549 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV1P50549 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV1P50549 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV1P50549 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV1P50549 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV1P50549 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV1P50549 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV1P50549 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV1P50549 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV1P50549 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV1P50549 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV1P50549 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ETV1P50549 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV1P50549 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETV1P50549 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms