Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGM4P49221 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM4P49221 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM4P49221 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM4P49221 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM4P49221 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM4P49221 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM4P49221 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM4P49221 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM4P49221 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM4P49221 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM4P49221 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM4P49221 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM4P49221 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM4P49221 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM4P49221 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM4P49221 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGM4P49221 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM4P49221 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM4P49221 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM4P49221 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM4P49221 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM4P49221 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM4P49221 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM4P49221 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM4P49221 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM4P49221 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM4P49221 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM4P49221 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM4P49221 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM4P49221 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM4P49221 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGM4P49221 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TGM4P49221 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TGM4P49221 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TGM4P49221 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TGM4P49221 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM4P49221 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM4P49221 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM4P49221 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM4P49221 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM4P49221 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM4P49221 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM4P49221 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM4P49221 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM4P49221 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM4P49221 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM4P49221 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM4P49221 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM4P49221 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM4P49221 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM4P49221 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM4P49221 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM4P49221 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM4P49221 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGM4P49221 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM4P49221 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM4P49221 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM4P49221 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM4P49221 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM4P49221 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM4P49221 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM4P49221 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM4P49221 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM4P49221 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM4P49221 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM4P49221 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM4P49221 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM4P49221 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM4P49221 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM4P49221 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TGM4P49221 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms