Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTDSS1P48651 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTDSS1P48651 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms