Protein–RNA interactions for Protein: P46990

RPL17B, 60S ribosomal protein L17-B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL17BP46990 YBR259WYBR259W 2067 nt6.68□□□□□ -1.34
RPL17BP46990 SFI1YLL003W 2841 nt6.68□□□□□ -1.34
RPL17BP46990 snR62snR62 100 nt6.67□□□□□ -1.34
RPL17BP46990 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt6.67□□□□□ -1.34
RPL17BP46990 RIM101YHL027W 1878 nt6.66□□□□□ -1.34
RPL17BP46990 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt6.66□□□□□ -1.34
RPL17BP46990 CCW12YLR110C 402 nt6.66□□□□□ -1.34
RPL17BP46990 RPL32YBL092W 393 nt6.66□□□□□ -1.34
RPL17BP46990 YBL112CYBL112C 318 nt6.66□□□□□ -1.34
RPL17BP46990 RQC1YDR333C 2172 nt6.66□□□□□ -1.34
RPL17BP46990 YGR250CYGR250C 2346 nt6.66□□□□□ -1.34
RPL17BP46990 VAC14YLR386W 2643 nt6.64□□□□□ -1.35
RPL17BP46990 MNT3YIL014W 1893 nt6.64□□□□□ -1.35
RPL17BP46990 GEF1YJR040W 2340 nt6.64□□□□□ -1.35
RPL17BP46990 PAU23YLR037C 375 nt6.64□□□□□ -1.35
RPL17BP46990 RPL36AYMR194W 303 nt6.64□□□□□ -1.35
RPL17BP46990 TIF4631YGR162W 2859 nt6.64□□□□□ -1.35
RPL17BP46990 PMP3YDR276C 168 nt6.63□□□□□ -1.35
RPL17BP46990 YGL260WYGL260W 231 nt6.63□□□□□ -1.35
RPL17BP46990 OCA5YHL029C 2040 nt6.63□□□□□ -1.35
RPL17BP46990 PBS2YJL128C 2007 nt6.63□□□□□ -1.35
RPL17BP46990 CSR1YLR380W 1227 nt6.63□□□□□ -1.35
RPL17BP46990 RPL33BYOR234C 324 nt6.63□□□□□ -1.35
RPL17BP46990 DPM1YPR183W 804 nt6.63□□□□□ -1.35
RPL17BP46990 SWA2YDR320C 2007 nt6.62□□□□□ -1.35
RPL17BP46990 YDR230WYDR230W 348 nt6.62□□□□□ -1.35
RPL17BP46990 YAE1YJR067C 426 nt6.62□□□□□ -1.35
RPL17BP46990 SEC5YDR166C 2916 nt6.62□□□□□ -1.35
RPL17BP46990 SSP1YHR184W 1716 nt6.62□□□□□ -1.35
RPL17BP46990 YEL073CYEL073C 324 nt6.61□□□□□ -1.35
RPL17BP46990 GNA1YFL017C 480 nt6.61□□□□□ -1.35
RPL17BP46990 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt6.61□□□□□ -1.35
RPL17BP46990 ACS1YAL054C 2142 nt6.6□□□□□ -1.35
RPL17BP46990 NKP2YLR315W 462 nt6.6□□□□□ -1.35
RPL17BP46990 AVT4YNL101W 2142 nt6.6□□□□□ -1.35
RPL17BP46990 SGF11YPL047W 300 nt6.6□□□□□ -1.35
RPL17BP46990 TDA1YMR291W 1761 nt6.59□□□□□ -1.35
RPL17BP46990 NTC20YBR188C 423 nt6.59□□□□□ -1.35
RPL17BP46990 YCR023CYCR023C 1836 nt6.59□□□□□ -1.35
RPL17BP46990 MET13YGL125W 1803 nt6.59□□□□□ -1.35
RPL17BP46990 THI21YPL258C 1656 nt6.58□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 THI2YBR240C 1353 nt6.58□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt6.58□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 IRC3YDR332W 2070 nt6.57□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 OPT2YPR194C 2634 nt6.57□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 AVT3YKL146W 2079 nt6.57□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 MES1YGR264C 2256 nt6.57□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 NOP53YPL146C 1368 nt6.57□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 SKN1YGR143W 2316 nt6.56□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 RSC9YML127W 1746 nt6.56□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 YER091C-AYER091C-A 222 nt6.56□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 SAE3YHR079C-A 276 nt6.56□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt6.56□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt6.56□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 SAR1YPL218W 573 nt6.56□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 YSH1YLR277C 2340 nt6.55□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 SPO21YOL091W 1830 nt6.55□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 SSQ1YLR369W 1974 nt6.55□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 RGD2YFL047W 2145 nt6.55□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 CCW14YLR390W-A 717 nt6.55□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 YOL046CYOL046C 675 nt6.55□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 PDE2YOR360C 1581 nt6.55□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 SIN4YNL236W 2925 nt6.55□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 BCH2YKR027W 2298 nt6.55□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 PAT1YCR077C 2391 nt6.54□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 FCY2YER056C 1602 nt6.54□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 NPC2YDL046W 522 nt6.54□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 CDC45YLR103C 1953 nt6.54□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 VHT1YGR065C 1782 nt6.54□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 JHD2YJR119C 2187 nt6.54□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 ADE6YGR061C 4077 nt6.53□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 PDI1YCL043C 1569 nt6.53□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 GPA2YER020W 1350 nt6.53□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 GLN3YER040W 2193 nt6.52□□□□□ -1.36
RPL17BP46990 LCD1YDR499W 2244 nt6.52□□□□□ -1.37
RPL17BP46990 RPL2AYFR031C-A 765 nt6.52□□□□□ -1.37
RPL17BP46990 YJL022WYJL022W 309 nt6.52□□□□□ -1.37
RPL17BP46990 CAR2YLR438W 1275 nt6.52□□□□□ -1.37
RPL17BP46990 YBL028CYBL028C 321 nt6.52□□□□□ -1.37
RPL17BP46990 PIG1YLR273C 1947 nt6.52□□□□□ -1.37
RPL17BP46990 SRP72YPL210C 1923 nt6.52□□□□□ -1.37
RPL17BP46990 MDM20YOL076W 2391 nt6.52□□□□□ -1.37
RPL17BP46990 NUP60YAR002W 1620 nt6.51□□□□□ -1.37
RPL17BP46990 PTR3YFR029W 2037 nt6.51□□□□□ -1.37
RPL17BP46990 AIM21YIR003W 2040 nt6.51□□□□□ -1.37
RPL17BP46990 GPD1YDL022W 1176 nt6.51□□□□□ -1.37
RPL17BP46990 RPL43AYPR043W 279 nt6.51□□□□□ -1.37
RPL17BP46990 YPR076WYPR076W 375 nt6.51□□□□□ -1.37
RPL17BP46990 KIP3YGL216W 2418 nt6.51□□□□□ -1.37
RPL17BP46990 HIS4YCL030C 2400 nt6.51□□□□□ -1.37
RPL17BP46990 MSH4YFL003C 2637 nt6.51□□□□□ -1.37
RPL17BP46990 ABZ1YNR033W 2364 nt6.51□□□□□ -1.37
RPL17BP46990 ATH1YPR026W 3636 nt6.5□□□□□ -1.37
RPL17BP46990 SUM1YDR310C 3189 nt6.5□□□□□ -1.37
RPL17BP46990 TPS2YDR074W 2691 nt6.5□□□□□ -1.37
RPL17BP46990 GOT1YMR292W 417 nt6.5□□□□□ -1.37
RPL17BP46990 EIS1YMR031C 2532 nt6.5□□□□□ -1.37
RPL17BP46990 PGM2YMR105C 1710 nt6.5□□□□□ -1.37
RPL17BP46990 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt6.49□□□□□ -1.37
RPL17BP46990 RPS27AYKL156W 249 nt6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.2 ms