Protein–RNA interactions for Protein: P46019

PHKA2, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, liver isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA2P46019 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA2P46019 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA2P46019 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA2P46019 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA2P46019 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA2P46019 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHKA2P46019 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHKA2P46019 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms