Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNT3P45378 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms