Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD52P43351 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD52P43351 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD52P43351 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD52P43351 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD52P43351 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD52P43351 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD52P43351 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD52P43351 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD52P43351 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD52P43351 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD52P43351 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD52P43351 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD52P43351 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD52P43351 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD52P43351 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD52P43351 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD52P43351 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD52P43351 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD52P43351 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD52P43351 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD52P43351 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD52P43351 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD52P43351 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD52P43351 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD52P43351 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD52P43351 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD52P43351 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD52P43351 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD52P43351 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD52P43351 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD52P43351 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD52P43351 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD52P43351 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD52P43351 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD52P43351 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD52P43351 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD52P43351 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD52P43351 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD52P43351 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD52P43351 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD52P43351 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD52P43351 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD52P43351 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD52P43351 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD52P43351 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD52P43351 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD52P43351 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD52P43351 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD52P43351 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD52P43351 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD52P43351 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD52P43351 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD52P43351 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD52P43351 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD52P43351 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD52P43351 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD52P43351 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD52P43351 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD52P43351 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD52P43351 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD52P43351 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD52P43351 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD52P43351 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD52P43351 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD52P43351 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD52P43351 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD52P43351 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD52P43351 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD52P43351 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD52P43351 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD52P43351 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD52P43351 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD52P43351 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD52P43351 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD52P43351 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD52P43351 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD52P43351 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD52P43351 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD52P43351 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD52P43351 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD52P43351 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD52P43351 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD52P43351 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD52P43351 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD52P43351 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD52P43351 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD52P43351 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD52P43351 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD52P43351 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD52P43351 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD52P43351 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD52P43351 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD52P43351 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD52P43351 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD52P43351 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD52P43351 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD52P43351 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD52P43351 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD52P43351 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms