Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IGHMBP2P38935 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IGHMBP2P38935 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms