Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms