Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ITGAEP38570 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ITGAEP38570 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms