Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.49
ZEB1P37275 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms