Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MYH11P35749 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYH11P35749 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYH11P35749 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYH11P35749 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYH11P35749 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYH11P35749 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYH11P35749 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYH11P35749 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYH11P35749 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH11P35749 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH11P35749 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH11P35749 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH11P35749 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH11P35749 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH11P35749 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH11P35749 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH11P35749 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH11P35749 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH11P35749 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH11P35749 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH11P35749 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH11P35749 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH11P35749 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH11P35749 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYH11P35749 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYH11P35749 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYH11P35749 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYH11P35749 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYH11P35749 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYH11P35749 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYH11P35749 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYH11P35749 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYH11P35749 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH11P35749 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH11P35749 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH11P35749 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH11P35749 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH11P35749 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH11P35749 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH11P35749 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH11P35749 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH11P35749 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH11P35749 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH11P35749 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH11P35749 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYH11P35749 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH11P35749 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH11P35749 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH11P35749 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH11P35749 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH11P35749 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH11P35749 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH11P35749 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH11P35749 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH11P35749 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH11P35749 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH11P35749 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH11P35749 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH11P35749 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH11P35749 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH11P35749 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYH11P35749 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH11P35749 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH11P35749 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH11P35749 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH11P35749 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH11P35749 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH11P35749 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH11P35749 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH11P35749 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH11P35749 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH11P35749 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH11P35749 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH11P35749 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH11P35749 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH11P35749 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH11P35749 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH11P35749 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH11P35749 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH11P35749 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH11P35749 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH11P35749 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH11P35749 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYH11P35749 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYH11P35749 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYH11P35749 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYH11P35749 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYH11P35749 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYH11P35749 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYH11P35749 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYH11P35749 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH11P35749 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH11P35749 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH11P35749 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH11P35749 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH11P35749 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH11P35749 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH11P35749 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH11P35749 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms