Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX1P32242 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX1P32242 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX1P32242 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX1P32242 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX1P32242 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX1P32242 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX1P32242 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX1P32242 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
OTX1P32242 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX1P32242 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX1P32242 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX1P32242 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX1P32242 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX1P32242 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX1P32242 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX1P32242 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX1P32242 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX1P32242 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX1P32242 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX1P32242 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX1P32242 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX1P32242 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX1P32242 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX1P32242 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX1P32242 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX1P32242 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX1P32242 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX1P32242 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX1P32242 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX1P32242 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX1P32242 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OTX1P32242 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX1P32242 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX1P32242 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX1P32242 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX1P32242 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX1P32242 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX1P32242 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX1P32242 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX1P32242 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX1P32242 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX1P32242 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX1P32242 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX1P32242 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX1P32242 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX1P32242 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX1P32242 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX1P32242 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX1P32242 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX1P32242 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX1P32242 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
OTX1P32242 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX1P32242 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX1P32242 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX1P32242 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX1P32242 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX1P32242 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX1P32242 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX1P32242 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX1P32242 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX1P32242 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX1P32242 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX1P32242 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX1P32242 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX1P32242 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX1P32242 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX1P32242 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX1P32242 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX1P32242 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTX1P32242 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX1P32242 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX1P32242 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX1P32242 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX1P32242 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX1P32242 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX1P32242 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX1P32242 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX1P32242 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX1P32242 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX1P32242 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX1P32242 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX1P32242 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX1P32242 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX1P32242 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX1P32242 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX1P32242 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX1P32242 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX1P32242 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX1P32242 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX1P32242 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX1P32242 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX1P32242 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX1P32242 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTX1P32242 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTX1P32242 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTX1P32242 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTX1P32242 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTX1P32242 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTX1P32242 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms