Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 LHFPL3-AS1-202ENST00000416376 866 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AL117339.1-201ENST00000419779 428 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 CFLAR-212ENST00000440180 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 E2F3P1-201ENST00000589887 1230 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXD11P31277 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 LYG1-201ENST00000308528 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AC007570.1-201ENST00000539987 603 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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