Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HLA-FP30511 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HLA-FP30511 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HLA-FP30511 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HLA-FP30511 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HLA-FP30511 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-FP30511 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms