Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND3P30281 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND3P30281 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND3P30281 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND3P30281 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND3P30281 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND3P30281 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND3P30281 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND3P30281 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND3P30281 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND3P30281 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND3P30281 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND3P30281 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND3P30281 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND3P30281 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND3P30281 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND3P30281 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND3P30281 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND3P30281 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND3P30281 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND3P30281 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND3P30281 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND3P30281 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND3P30281 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND3P30281 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND3P30281 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND3P30281 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND3P30281 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND3P30281 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND3P30281 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND3P30281 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND3P30281 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND3P30281 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND3P30281 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND3P30281 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND3P30281 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND3P30281 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND3P30281 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND3P30281 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND3P30281 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND3P30281 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND3P30281 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND3P30281 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND3P30281 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND3P30281 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND3P30281 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND3P30281 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCND3P30281 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCND3P30281 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCND3P30281 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCND3P30281 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCND3P30281 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCND3P30281 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCND3P30281 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCND3P30281 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCND3P30281 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCND3P30281 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCND3P30281 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCND3P30281 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCND3P30281 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCND3P30281 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCND3P30281 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCND3P30281 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCND3P30281 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCND3P30281 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCND3P30281 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCND3P30281 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCND3P30281 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCND3P30281 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCND3P30281 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCND3P30281 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCND3P30281 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCND3P30281 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCND3P30281 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCND3P30281 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCND3P30281 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCND3P30281 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCND3P30281 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCND3P30281 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCND3P30281 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCND3P30281 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCND3P30281 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCND3P30281 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCND3P30281 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCND3P30281 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCND3P30281 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCND3P30281 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCND3P30281 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCND3P30281 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCND3P30281 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCND3P30281 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCND3P30281 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCND3P30281 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCND3P30281 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCND3P30281 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCND3P30281 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCND3P30281 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCND3P30281 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCND3P30281 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCND3P30281 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms