Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC27P30260 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC27P30260 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC27P30260 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC27P30260 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC27P30260 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC27P30260 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC27P30260 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC27P30260 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC27P30260 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC27P30260 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC27P30260 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC27P30260 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC27P30260 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC27P30260 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC27P30260 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC27P30260 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC27P30260 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC27P30260 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC27P30260 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC27P30260 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC27P30260 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC27P30260 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC27P30260 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC27P30260 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC27P30260 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC27P30260 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC27P30260 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC27P30260 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC27P30260 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC27P30260 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC27P30260 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC27P30260 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC27P30260 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC27P30260 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC27P30260 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC27P30260 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC27P30260 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC27P30260 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC27P30260 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC27P30260 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC27P30260 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC27P30260 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC27P30260 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC27P30260 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC27P30260 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC27P30260 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC27P30260 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC27P30260 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC27P30260 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC27P30260 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC27P30260 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC27P30260 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC27P30260 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC27P30260 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC27P30260 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC27P30260 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC27P30260 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC27P30260 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC27P30260 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC27P30260 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC27P30260 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC27P30260 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC27P30260 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC27P30260 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC27P30260 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC27P30260 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC27P30260 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC27P30260 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CDC27P30260 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDC27P30260 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC27P30260 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC27P30260 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC27P30260 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC27P30260 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC27P30260 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC27P30260 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC27P30260 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC27P30260 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC27P30260 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC27P30260 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC27P30260 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC27P30260 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC27P30260 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC27P30260 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC27P30260 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC27P30260 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC27P30260 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC27P30260 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC27P30260 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC27P30260 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC27P30260 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC27P30260 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC27P30260 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC27P30260 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC27P30260 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC27P30260 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC27P30260 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC27P30260 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC27P30260 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms