Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ECHS1P30084 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ECHS1P30084 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms