Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5DP30049 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5DP30049 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms