Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
PTPRMP28827 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms