Protein–RNA interactions for Protein: P27824

CANX, Calnexin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CANXP27824 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CANXP27824 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CANXP27824 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CANXP27824 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CANXP27824 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CANXP27824 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CANXP27824 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CANXP27824 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CANXP27824 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CANXP27824 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CANXP27824 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CANXP27824 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CANXP27824 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CANXP27824 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CANXP27824 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CANXP27824 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CANXP27824 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CANXP27824 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CANXP27824 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CANXP27824 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CANXP27824 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CANXP27824 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CANXP27824 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CANXP27824 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CANXP27824 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CANXP27824 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CANXP27824 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CANXP27824 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CANXP27824 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CANXP27824 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CANXP27824 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CANXP27824 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CANXP27824 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CANXP27824 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CANXP27824 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CANXP27824 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CANXP27824 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CANXP27824 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CANXP27824 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CANXP27824 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CANXP27824 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CANXP27824 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CANXP27824 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CANXP27824 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CANXP27824 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CANXP27824 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CANXP27824 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CANXP27824 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CANXP27824 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CANXP27824 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CANXP27824 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CANXP27824 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CANXP27824 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CANXP27824 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CANXP27824 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CANXP27824 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CANXP27824 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CANXP27824 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CANXP27824 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CANXP27824 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CANXP27824 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CANXP27824 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CANXP27824 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CANXP27824 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CANXP27824 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CANXP27824 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CANXP27824 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CANXP27824 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CANXP27824 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CANXP27824 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CANXP27824 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CANXP27824 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CANXP27824 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CANXP27824 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CANXP27824 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CANXP27824 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CANXP27824 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CANXP27824 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CANXP27824 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CANXP27824 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CANXP27824 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CANXP27824 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CANXP27824 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CANXP27824 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CANXP27824 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CANXP27824 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CANXP27824 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CANXP27824 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CANXP27824 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CANXP27824 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CANXP27824 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CANXP27824 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CANXP27824 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CANXP27824 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CANXP27824 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CANXP27824 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CANXP27824 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CANXP27824 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CANXP27824 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CANXP27824 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms