Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR2AP24928 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms