Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKCHP24723 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCHP24723 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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