Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
KDELR1P24390 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDELR1P24390 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms