Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2B4P23634 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms