Protein–RNA interactions for Protein: P22217

TRX1, Thioredoxin-1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRX1P22217 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt2.56□□□□□ -2
TRX1P22217 YER189WYER189W 369 nt2.56□□□□□ -2
TRX1P22217 RPL22BYFL034C-A 369 nt2.56□□□□□ -2
TRX1P22217 LSM12YHR121W 564 nt2.56□□□□□ -2
TRX1P22217 SVP26YHR181W 687 nt2.56□□□□□ -2
TRX1P22217 RPL25YOL127W 429 nt2.56□□□□□ -2
TRX1P22217 snR43snR43 209 nt2.56□□□□□ -2
TRX1P22217 YFH1YDL120W 525 nt2.55□□□□□ -2
TRX1P22217 ADK1YDR226W 669 nt2.55□□□□□ -2
TRX1P22217 HOS4YIL112W 3252 nt2.55□□□□□ -2
TRX1P22217 SLN1YIL147C 3663 nt2.55□□□□□ -2
TRX1P22217 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.55□□□□□ -2
TRX1P22217 ATG10YLL042C 504 nt2.55□□□□□ -2
TRX1P22217 ESF2YNR054C 951 nt2.55□□□□□ -2
TRX1P22217 CSI2YOL007C 1026 nt2.55□□□□□ -2
TRX1P22217 SGT1YOR057W 1188 nt2.55□□□□□ -2
TRX1P22217 TMA64YDR117C 1698 nt2.54□□□□□ -2
TRX1P22217 PDR3YBL005W 2931 nt2.54□□□□□ -2
TRX1P22217 MRP10YDL045W-A 288 nt2.54□□□□□ -2
TRX1P22217 YRB1YDR002W 606 nt2.54□□□□□ -2
TRX1P22217 YER138W-AYER138W-A 105 nt2.54□□□□□ -2
TRX1P22217 RPL11BYGR085C 525 nt2.54□□□□□ -2
TRX1P22217 CUP1-1YHR053C 186 nt2.54□□□□□ -2
TRX1P22217 CUP1-2YHR055C 186 nt2.54□□□□□ -2
TRX1P22217 RRT16YNL105W 429 nt2.54□□□□□ -2
TRX1P22217 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt2.54□□□□□ -2
TRX1P22217 RPL11AYPR102C 525 nt2.54□□□□□ -2
TRX1P22217 YPR097WYPR097W 3222 nt2.54□□□□□ -2
TRX1P22217 HSC82YMR186W 2118 nt2.54□□□□□ -2
TRX1P22217 NUP100YKL068W 2880 nt2.54□□□□□ -2
TRX1P22217 KEL2YGR238C 2649 nt2.54□□□□□ -2
TRX1P22217 UBP16YPL072W 1500 nt2.53□□□□□ -2
TRX1P22217 STE11YLR362W 2154 nt2.53□□□□□ -2
TRX1P22217 ATC1YDR184C 885 nt2.53□□□□□ -2
TRX1P22217 COG2YGR120C 789 nt2.53□□□□□ -2
TRX1P22217 RTS3YGR161C 792 nt2.53□□□□□ -2
TRX1P22217 YGR293CYGR293C 462 nt2.53□□□□□ -2
TRX1P22217 YJR056CYJR056C 711 nt2.53□□□□□ -2
TRX1P22217 RCE1YMR274C 948 nt2.53□□□□□ -2
TRX1P22217 PET20YPL159C 762 nt2.53□□□□□ -2
TRX1P22217 UBS1YBR165W 834 nt2.53□□□□□ -2
TRX1P22217 SSP1YHR184W 1716 nt2.53□□□□□ -2
TRX1P22217 TUS1YLR425W 3924 nt2.53□□□□□ -2
TRX1P22217 ESC1YMR219W 4977 nt2.52□□□□□ -2.01
TRX1P22217 CST9YLR394W 1449 nt2.52□□□□□ -2.01
TRX1P22217 EDS1YBR033W 2760 nt2.52□□□□□ -2.01
TRX1P22217 SIR4YDR227W 4077 nt2.52□□□□□ -2.01
TRX1P22217 PHO91YNR013C 2685 nt2.52□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt2.52□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt2.52□□□□□ -2.01
TRX1P22217 CBS2YDR197W 1170 nt2.52□□□□□ -2.01
TRX1P22217 CTK2YJL006C 972 nt2.52□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YNL046WYNL046W 519 nt2.52□□□□□ -2.01
TRX1P22217 GRE2YOL151W 1029 nt2.52□□□□□ -2.01
TRX1P22217 INP53YOR109W 3324 nt2.52□□□□□ -2.01
TRX1P22217 SIP3YNL257C 3690 nt2.52□□□□□ -2.01
TRX1P22217 BFR1YOR198C 1413 nt2.51□□□□□ -2.01
TRX1P22217 STI1YOR027W 1770 nt2.51□□□□□ -2.01
TRX1P22217 BUB1YGR188C 3066 nt2.51□□□□□ -2.01
TRX1P22217 SDC1YDR469W 528 nt2.51□□□□□ -2.01
TRX1P22217 SLD5YDR489W 885 nt2.51□□□□□ -2.01
TRX1P22217 OST5YGL226C-A 261 nt2.51□□□□□ -2.01
TRX1P22217 UTP30YKR060W 825 nt2.51□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YLR050CYLR050C 486 nt2.51□□□□□ -2.01
TRX1P22217 MRPS8YMR158W 468 nt2.51□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YIP3YNL044W 531 nt2.51□□□□□ -2.01
TRX1P22217 snR24snR24 89 nt2.51□□□□□ -2.01
TRX1P22217 SEC66YBR171W 621 nt2.51□□□□□ -2.01
TRX1P22217 MBA1YBR185C 837 nt2.51□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YBR209WYBR209W 318 nt2.51□□□□□ -2.01
TRX1P22217 PSD2YGR170W 3417 nt2.51□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YDR186CYDR186C 2634 nt2.51□□□□□ -2.01
TRX1P22217 PRP8YHR165C 7242 nt2.5□□□□□ -2.01
TRX1P22217 NGG1YDR176W 2109 nt2.5□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YER138CYER138C 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YER160CYER160C 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YJR027WYJR027W 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YML039WYML039W 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YML045WYML045W 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YMR050CYMR050C 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.5□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.5□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YDR338CYDR338C 2088 nt2.5□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.5□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YGR053CYGR053C 852 nt2.5□□□□□ -2.01
TRX1P22217 TWF1YGR080W 999 nt2.5□□□□□ -2.01
TRX1P22217 SYS1YJL004C 612 nt2.5□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.5□□□□□ -2.01
TRX1P22217 YPT52YKR014C 705 nt2.5□□□□□ -2.01
TRX1P22217 ECI1YLR284C 843 nt2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45 ms