Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERBB3P21860 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERBB3P21860 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERBB3P21860 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERBB3P21860 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERBB3P21860 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERBB3P21860 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERBB3P21860 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERBB3P21860 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERBB3P21860 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERBB3P21860 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERBB3P21860 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERBB3P21860 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERBB3P21860 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERBB3P21860 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERBB3P21860 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERBB3P21860 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERBB3P21860 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERBB3P21860 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERBB3P21860 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERBB3P21860 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERBB3P21860 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERBB3P21860 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERBB3P21860 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERBB3P21860 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERBB3P21860 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERBB3P21860 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ERBB3P21860 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ERBB3P21860 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERBB3P21860 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ERBB3P21860 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERBB3P21860 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERBB3P21860 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERBB3P21860 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERBB3P21860 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ERBB3P21860 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ERBB3P21860 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERBB3P21860 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERBB3P21860 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ERBB3P21860 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERBB3P21860 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERBB3P21860 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ERBB3P21860 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERBB3P21860 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERBB3P21860 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERBB3P21860 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERBB3P21860 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERBB3P21860 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ERBB3P21860 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERBB3P21860 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERBB3P21860 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERBB3P21860 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERBB3P21860 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERBB3P21860 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ERBB3P21860 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ERBB3P21860 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ERBB3P21860 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ERBB3P21860 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERBB3P21860 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERBB3P21860 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERBB3P21860 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERBB3P21860 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERBB3P21860 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERBB3P21860 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERBB3P21860 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ERBB3P21860 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ERBB3P21860 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ERBB3P21860 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ERBB3P21860 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERBB3P21860 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERBB3P21860 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERBB3P21860 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
ERBB3P21860 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ERBB3P21860 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ERBB3P21860 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ERBB3P21860 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ERBB3P21860 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ERBB3P21860 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERBB3P21860 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ERBB3P21860 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ERBB3P21860 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERBB3P21860 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERBB3P21860 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERBB3P21860 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERBB3P21860 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERBB3P21860 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERBB3P21860 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERBB3P21860 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERBB3P21860 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ERBB3P21860 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERBB3P21860 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ERBB3P21860 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERBB3P21860 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ERBB3P21860 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERBB3P21860 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERBB3P21860 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERBB3P21860 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ERBB3P21860 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERBB3P21860 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERBB3P21860 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms